1、细菌  

  细菌这一术语包括了由几千种单细胞生物组成的一大微生物种群。细菌是无处不在：空气中、水中、土壤中、活的或死的较高级的生物体内及体外。细菌既存在于周围环境中，也存在于人体内。细菌是洁净室最普通的微生物污染物。  

2、藻类  

  藻类与其他微生物的不同之处在于，它能进行光合作用。藻类在污染控制和洁净室一般不是问题，但是对于像水的再循环系统，藻类就可能造成影响。  

3、真菌类  

  在污染控制和洁净室领域，真菌是第二大微生物污染源，并会成为一种严重威胁。真菌与大多数细菌相比，对养分的要求更简单，并能够在没有大量水的条件下生长。酵母菌很少成为污染控制和洁净室中的污染物。但是，它们可能会在某些碳水化合物上和水含量高的产品上生长。  

4、病毒  

  病毒在微生物中处在很独特的位置。因为按照一般所接受的概念，不能将其分类为活的有机生物。它们的构造相当简单，常常是由一层蛋白质内的单个DNA和RNA分子组成，比微生物小得多。  

5、原生物  

  由于原生物差不多总是于天然形成的水环境相关联，所以它们在污染控制和洁净室领域无足轻重。