正压净化室是目前保证食品加工环境安全的重要方式之一，由于本身不具备杀菌功能，且只能通过控制尘埃的方式降低微生物含量。只要开机运行，其“微污染源”将逐一显现，如空调表冷器滋生细菌、管道内壁繁衍细菌、蔓延细菌等。为避免食品企业重资金投入无尘洁净室保证食品生产安全，却未能完全杜绝“微污染”隐患，对于此：

    1、员工之管理，在洁净室内污染来源80％来自作业人员，若能使作业人员依洁净室管理办法确实执行管理，而所有人员也均配合实施，则污染源的产生可说已减少大半。

    2、进入洁净室员工，必须要具备有达成高洁净度标准，并要维持最好状态的观念。

    3、员工进入洁净室数目以维持最小限度为原则（愈小愈好），并须依洁净室进出标准流程进出洁净室。出则相反方向进行，唯不须经缓冲通道或风淋室脱尘处理。

4、对洁净室的空调系统及通风系统内安装动态杀菌装置。