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中国医药工程设计协会曾组织专家对三个甲级医药设计院、13个乙级医药设计院检查了20项初步设计、32项施工图设计、20个项目现场，检查文字表格约16600页、图纸约8900张，并和有关设计人员、管理人员进行了座谈，检查出各类问题约560条。这些问题的提出和解决，凝聚了全体检查人员的辛勤劳动，是一笔宝贵财富，对防止类似问题的发生和提高设计质量颇有益处，故将当时检查中提出的问题归纳整理如下，供医药设计行业的同仁们参考。
初步设计方面的主要问题是部分初步设计深度不够。
1)方案论证应在可行性阶段，但没有可以证明已作过方案论证的记录材料。
2)缺乏立项的依据文件，对设计的背景依据性资料论述不足。
3)没有进行必要的物料衡算、热量衡算。
4)没有必要的专篇(章)，如节能、环保、职业安全卫生等。即使有的，论述也比较笼统。
5)工艺流程太简单，物料的流向不清，介质名称、管道直径尺寸未标出。初设的工艺流程图应有带控制点的工艺管道图。
6)设备一览表上没有型号、规格、温度、压力等主要的技术参数。
7)总平面图上没有座标、或没有相对尺寸，没有周围道路情况、道路宽度和位置。
8)车间布置图上没有必要的净化区划分，没有房间名称，没有楼层的标高。
9)对建构筑物的特性没有说明，缺少防火、防爆、防潮、防静电、防腐蚀、洁净级别、照度、工作高度等许多特性要求和参数；建构筑物平立面图上缺少楼层、地面、屋顶、墙柱、门窗等材料装修标准及必要的设计说明。
10)“三废”的去向交待不清，没有本项工程的污水水质和执行几类排放标准的说明，没有地区环境现状、原有车间污染情况和治理措施，没有新建车间污染物数量和当地环保部门对此的处理要求。
11)没有室内消防平面图、没有消防器材一览表，在消防篇内没有消防水供应量、没有水压和用量的说明，没有消防的系统图。
12)在片剂生产中原料混合部分没有防尘设施的说明。
13)对产品的特性，如易氧化、易受潮等都未在产品质量标准章节中加以说明。
14)对工艺用压缩空气没有提出无水、无油、无尘的要求。
15)总的排水量表不完整，无合计的水量、无雨水量和计算结果，水量平衡图画法有误，看不出是否平衡，排水管径确定缺乏依据。
16)电气设计、负荷计算表不详细、各种功能房间的照度值没有确定，建构筑物的防雷等级没有确定。
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